A l’analyse anatomopathologique de la tumeur (analyse au microscope, qui se déroule après le prélèvement de la tumeur au bloc opératoire), on distingue 2 types de craniopharyngiome : les craniopharyngiomes adamantins (ou adamantinomateux) et les craniopharyngiomes papillaires.
Les craniopharyngiomes adamantins, les plus fréquents, sont des tumeurs calcifiées, qui se rencontrent chez l’enfant et chez l’adulte.
Les craniopharyngiomes papillaires, plus rares, ne sont qu’exceptionnellement calcifiés, et ne se rencontrent que chez l’adulte. Ils ont la particularité d’être associés à une mutation (BRAF p.V600E) dans 90% des cas. Les craniopharyngiomes BRAF mutés sont généralement sensibles à un traitement médicamenteux ciblé, qui permet une réduction du volume tumoral dans la majorité des cas.